Il 4 febbraio 1798 Perugia viene occupata dai francesi che instaurano un Governo Popolare a cui subentra dopo il 15 febbraio la Repubblica Romana. Perugia diventa capoluogo del Dipartimento del Trasimeno e sede del Prefetto Consolare. In questo periodo la zecca, pur in presenza dell’ordine di chiusura generale di tutte le zecche regionali del 28 novembre 1797, continua abusivamente a coniare madonnine mediante ribattitura di sampietrini, utilizzando i conii che non erano stati riconsegnati a Roma. Dai documenti d’archivio risulta che venivano accaparrati i sampietrini logori sul mercato a baiocchi uno e mezzo e rimessi in circolazione con il nuovo conio a baiocchi tre, raddoppiando, di fatto, il valore della moneta di rame in circolazione (anche la zecca di Fermo, in misura minore, è coinvolta in questo grave scandalo monetario). Il 9 luglio 1798 il Consolato ordina l’immediata chiusura della zecca di Perugia (e di Fermo e in via provvisoria di tutte le zecche operanti) e la riconsegna dei conii pontifici. Queste monete sono facilmente individuabili in quanto presentano tracce piú o meno evidenti dell’impronta originaria.

Con l’occupazione di Roma da parte delle truppe napoletane (26 novembre 1798), Perugia diventa sede del Governo Repubblicano. Tra le varie disposizioni emanate in questo periodo c’è il decreto con cui si dispone di utilizzare l’argento requisito per l’emissione di uno scudo repubblicano. Nei primi mesi del 1799 la zecca perugina emette anche madonnine dal valore di tre baiocchi.

A fino agosto Perugia viene abbandonata dai francesi per l’arrivo delle truppe austriache che istituiscono una Reggenza Provvisoria. Anche durante questo periodo vengono emesse madonnine utilizzando i pezzi repubblicani di cui era iniziato il ritiro. Questi esemplari sono facilmente individuabili sia dalla presenza di precedenti leggende, sia dal fatto che i conii utilizzati non sono quelli attribuibili al Mercandetti.